酵子和酵母有的区别在于性质和外观不同，酵子，又称作酵头、面肥、老肥、面引子等，外表是有点偏土黄色的块絮状，而酵母的外表是细小的黄色，酵母是一种单细胞真菌。酵子是多菌种的混合发酵体系，主要依靠酵母菌、霉菌、乳酸菌等微生物的呼吸作用等协同作用，使得馒头的质地和风味等产生变化，而酵母是基因克隆实验中常用的真核生物受体细胞，培养酵母菌和培养大肠杆菌一样方便。
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